Normálna funkcia kalprotektínu je teda pôsobiť proti vývoju baktérií a húb vo vnútri tela (antimikrobiálna aktivita).
V prítomnosti „zápalu v gastrointestinálnom trakte k nemu migrujú biele krvinky a uvoľňujú proteín, ktorého koncentrácia v stolici sa podľa toho zvyšuje.
Z tohto dôvodu môže byť kalprotektín použitý ako indikátor zápalu v prípade chronických črevných ochorení, niektorých infekcií bakteriálneho pôvodu alebo rakoviny tráviaceho systému.
Fekálna dávka kalprotektínu je jediným testom, ktorý môže poskytnúť informácie o mieste zápalu. Stanovenie parametra v plazme na druhej strane zdôrazňuje zápalový stav, ktorý môže byť lokalizovaný kdekoľvek. Okrem toho u pacientov s chronickými zápalovými ochoreniami čriev (ako je ulcerózna kolitída a Crohnova choroba) je dávka fekálneho kalprotektínu platným indexom stupňa zápalu.
; prítomný vo všetkých častiach ľudského tela, je koncentrovaný hlavne v cytoplazme neutrofilných granulocytov.V nižších koncentráciách je kalprotektín prítomný aj v monocytoch a v makrofágoch, ktoré z nich pochádzajú; tieto bunky, podobne ako neutrofily, sú biele krvinky určené na fagocytáciu - teda na obklopenie, trávenie a ničenie - cudzích častíc, ktoré prenikli do organizmu, vrátane mikroorganizmov (voči ktorým sú neutrofily aktívnejšie).
Neutrofily aj makrofágy majú schopnosť vylučovať chemické mediátory zápalovej reakcie.
V týchto imunitných bunkách vykazuje kalprotektín vysokú bakteriostatickú a mykostatickú aktivitu; ako taký účinne pôsobí proti rastu plesní a baktérií.
