Β-oxidácia je súbor procesov, ktoré prebiehajú na uhlíku v Β na karbonylovú skupinu.
Prvým enzýmom v tomto procese je „acylkoenzým A dehydrogenáza ktorý sa nachádza na vnútornej mitochondriálnej membráne a má FAD ako kofaktor, ktorý je redukovaný na FADH2 a dodáva svoju redukčnú silu koenzýmu Q (dýchací reťazec); tento enzým katalyzuje reakciu, ktorá z acyl koenzýmu A vedie k tvorbe enoyl koenzýmu A (presnejšie trans 2,3 enoyl koenzýmu A), čo je nenasýtený systém α-Β (alkén). Druhý enzým b-oxidácie je "enoyl koenzým A hydratáza ktorý premieňa enoyl na L-hydroxyhydroxy acyl koenzým A; tento enzým je pre izomér L-hydroxy hydroxy acyl koenzýmu A úplne stereošpecifický.
Nasledujúca reakcia je katalyzovaná L-hydroxyacyl koenzým A dehydrogenáza (Enzým závislý od NAD), ktorý prevádza L-Β hydroxy acyl koenzým A na b-keto acyl koenzým A; súčasne dochádza k redukcii NAD + na NADH.
Nakoniec zasahuje jeden thioláza (b-keto acyl koenzým A tioláza); reakcia vyžaduje aj lytické činidlo predstavované koenzýmom A: vytvorí sa fragment s dvoma atómami uhlíka (tj. „acetylkoenzým A) a zostávajúca uhlíková kostra predstavuje acylkoenzým A (v porovnaní s východiskovým stratil dva atómy uhlíka ).
Acylkoenzým A získaný s Β-oxidácia, opakuje proces, kým sa nezíska iba acetylkoenzým A.
Takmer absolútne pravidlo: keď k dehydrogenácii dôjde medzi dvoma susednými atómami s jasným rozdielom v afinite k elektrónom, kofaktorom enzýmu dehydrogenázy je takmer vždy NAD, pričom ak k dehydrogenácii dôjde medzi dvoma susednými atómami vrátane c „, je malý rozdiel v afinite elektrónov , kofaktorom je FAD.