Z chemického hľadiska je fondaparinux syntetický pentasacharid síranu, ktorého chemická štruktúra je založená na aktívnej časti nefrakcionovaného heparínu.
Fungaparín, podobne ako iné lieky na báze heparínu, musí byť podávaný parenterálne a najmä subkutánnou injekciou. V niektorých prípadoch však účinnú látku môže podávať aj intravenózne špecializovaný zdravotnícky personál.
V Taliansku je fondaparinux dostupný v jednom lieku s názvom Arixrtra®. Tento liek je vo forme injekčného roztoku pripraveného na použitie, ktorý je obsiahnutý v naplnených injekčných striekačkách. Na výdaj tohto lieku je potrebný lekársky predpis. opakovateľné; keďže je však zaradený medzi lieky triedy A, jeho náklady (určite vysoké) môže preplatiť Národný zdravotný systém (NHS).
